Para converter os nomes de um conjunto de arquivos para que todas as letras fiquem minúscula basta utilizar o seguinte comando:
rename 'y/A-Z/a-z/' *
Todos os arquivos no diretório corrente serão convertidos.
Fonte de referência: http://www.cyberciti.biz/tips/renaming-multiple-files-at-a-shell-prompt.html